Los objetivos específicos de este Máster son:

• Capacitar a los alumnos en el análisis de las diferentes formas de contaminación en sistemas complejos y altamente interrelacionados.
• Desarrollar en los alumnos competencias para identificar y evaluar los efectos tóxicos de contaminantes ambientales en la atmósfera, el suelo y el medio hídrico así como en las distintas interfases.
• Capacitar a los estudiantes en la óptima elección, diseño y especificación de los medios avanzados (tecnologías o prácticas) de prevención, eliminación o reducción de la contaminación, que existen, fundamentalmente, sobre el suelo, el medio hídrico y  la atmósfera.
• Los estudiantes obtendrán los conocimientos avanzados de química ambiental, ecología y de salud pública con el fin de identificar y evaluar los efectos directos e indirectos sobre los seres humanos y el medio natural de los contaminantes ambientales en sistemas complejos y altamente interrelacionados.
• Los estudiantes tendrán capacidad para abordar problemas complejos de toxicología ambiental desde un punto de vista científico y tecnológico que permita el análisis en profundidad de los riesgos toxicológicos y la modelización matemática de los vectores de contaminación para la predicción integral de efectos.
• Desarrollar en los estudiantes los conocimientos avanzados necesarios para la elección de la mejor solución de remediación ambiental en caso de accidentes ambientales y la estimación de los costes asociados utilizando las mejores tecnologías disponibles.
• Aprender los fundamentos básicos de la metodología de la investigación aplicada a las Ciencias de la Salud, como base para la mejor comprensión de los textos científicos y como inicio de la práctica en proyectos de investigación.